ПРОБЛЕМАТИКА ДОСТУПНОСТИ БАЗ ОДНОКЛЕТОЧНЫХ ОМИКСНЫХ ДАННЫХ ЧЕЛОВЕКА
Article Sidebar
Main Article Content
Abstract
Стремительное развитие технологий одноклеточного секвенирования привело к накоплению значительных объемов омиксных данных человека, характеризующих молекулярные особенности отдельных клеток. Базы одноклеточных данных играют ключевую роль в хранении, обработке и повторном использовании результатов исследований. Вместе с тем доступность таких данных сопровождается рядом проблем, включая фрагментацию информационных ресурсов, отсутствие единых стандартов метаданных, ограничения доступа, связанные с защитой персональных данных, а также высокие требования к вычислительной инфраструктуре. В статье рассматриваются основные проблемы доступности баз одноклеточных омиксных данных человека, анализируются существующие международные инициативы по их решению и определяются перспективные направления развития биоинформационных платформ. Особое внимание уделяется принципам FAIR, вопросам интероперабельности данных и повышению эффективности международного научного сотрудничества. [1; 4]
Article Details
Section
References
1. Lähnemann Dennis, Köster Johannes и др. Eleven grand challenges in single-cell data science // Genome Biology. 2020. Т. 21. № 1. С. 31.
2. Regev Aviv, Teichmann Sarah A., Lander Eric S. и др. The Human Cell Atlas // eLife. 2017. Vol. 6. e27041.
3. Stuart Tim, Butler Andrew и др. Comprehensive Integration of Single-Cell Data // Cell. 2019. Vol. 177. № 7. P. 1888–1902.
4. Wilkinson Mark D., Dumontier Michel и др. The FAIR Guiding Principles for scientific data management and stewardship // Scientific Data. 2016. Vol. 3. Article 160018.
5. National Center for Biotechnology Information. Gene Expression Omnibus (GEO): Data Repository for Functional Genomics.
6. European Molecular Biology Laboratory. Single Cell Expression Atlas.
7. European Genome-phenome Archive. Controlled Access Human Genomic Data Repository